植物与病原真菌互作功能基因组学团队

  发布时间: 2017-02-28   信息员:

 

研究方向

 本团队利用基因组、转录组、蛋白质组等高通量组学技术,重点围绕稻瘟病菌Magnaporthe oryzae)和禾谷镰刀菌Fusarium graminearum)这两种病害,在水稻、拟南芥和烟草等模式植物上,开展植物病原真菌病害灾变机制、生长发育和致病机理、真菌和植物互作分子机制等方面研究。具体研究方向:

  1. 稻瘟菌无毒基因定位、克隆与变异机制研究

  2. 稻瘟菌效应蛋白的鉴定、定位、运输途径与功能研究

  3. 稻瘟菌生长、产孢、侵染与致病等过程关键因子鉴定与研究

  4. 禾谷镰刀菌生长发育和致病性分子调控机制研究

  5. 拟南芥与菌核病菌互作分子机制的研究

招生专业

 生化与分子生物学、微生物学、遗传学、生物信息学

研究生培养情况

 目前实验室有近百名在读研究生(含8名留学生)和8名脱产博士后。已培养硕士研究生200余人,8人出国攻读博士学位;博士研究生20人,5人进入美国加州大学河滨分校、德州农工大学等世界名校从事博士后研究。

2016年实验室有3人获得研究生国家奖学金;1人获得福建农林大学优秀博士学位论文基金资助3名研究生的毕业论文被评为福建农林大学优秀毕业论文,其中1名研究生的毕业论文被推荐参评福建省优秀毕业论文;5人赴美国德州农工大学联合培养,1人赴匈牙利攻读博士学位。

在研项目

  1. 国家自然科学基金海峡联合基金:基于闽台稻瘟病菌群体演化特点探讨水稻持久抗瘟生态防控策略,U13052112014-2017260万,王宗华(负责人)

  2. 国家自然科学基金海峡联合基金:闽台水稻种质稻瘟病基础抗性基因资源挖掘及抗性机制研究U14052122015-2018259,陈松彪(负责人)

  3. 国家自然科学基金面上项目: Rab家族小G蛋白调控禾谷镰刀菌DON毒素合成与分泌的分子机制,316701422017-202065万,周洁(负责人)

  4. 国家自然科学基金面上项目:调控水稻类病斑细胞死亡及抗病应答的色氨酸代谢链的研究,314717602015-201888,陈松彪(负责人)

  5.  国家自然科学基金:油菜SYP122及其Qa-SNARE亚家族成员在菌核病抗性调控中的功能分析314717392015-201880万,陈晓婷(参与)

  6. 国家自然科学基金青年基金项目:稻瘟病菌无毒基因Avr-Pikh的克隆与分析,314016922015-201724万,陈晓峰(负责人)

  7. 国家自然科学基金青年基金项目:PEX5调控轮枝镰刀菌致病性及伏马毒素FB1合成的功能研究,316015992017-201920万,余文英(负责人)

  8. 国家自然科学基金青年基金项目:稻瘟病菌一候选效应因子PP1的特异细胞定位及其功能研究,31601596,2017-201920万,郑文辉(负责人)

  9. 福建省自然科学基金杰青滚动项目:抗病基因介导水稻抗稻瘟病的分子网络,2014J070042014-201750万,陈松彪(负责人)

  10. 福建农林大学杰青项目,稻瘟菌无毒基因变异机制和监测方法研究,XJQ2015112015-201830万,鲍坚东(负责人)

  11. 福建农林大学国际合作项目,稻瘟病菌中Retromercargo鉴定及其与Rab蛋白关系研究,KXB16010A2017-202020万,周洁(负责人)

  12. 福建省烟草公司南平市公司项目,烟草钾的吸收积累与调控研究,2016350700201142016-201712万,刘泓(负责人)

  13.  南平市烟草公司项目,烤烟减肥增效土壤培肥研究,NYK2016-03-03 2016-201943万,刘泓(负责人)

近三年代表性论文

  1. Xiaofeng Chen†, Daniel J Ebbole, Zonghua Wang*.The exocyst complex: delivery hub for morphogenesis and pathogenesis in filamentous fungi[J].Curr Opin Plant Biol., 2015,28: 48-54.(IF=7.848)

  2. Wenhui Zheng†, Jie Zhou†, Yunlong He,  Qiurong Xie , Ahai Chen , Huawei Zheng, Lei Shi, Xu Zhao , Chengkang Zhang , Qingping Huang, Kunhai Fang, Guodong Lu, Daniel J Ebbole,  Guangpu Li, Naweed Naqvi*, Zonghua Wang*.Retromer Is Essential for Autophagy-Dependent Plant Infection by the Rice Blast Fungus[J].PLoS Genet. 2015,11(12):e1005704 (IF= 7.528)

  3. Wenhui Zheng, Huawei Zheng, Xu Zhao, Ying Zhang, Qiurong Xie, Xiaolian Lin, Ahai Chen,Wenying Yu, Guodong Lu, Won-Bo Shim, Jie Zhou* ,Zonghua Wang*. Retrograde trafficking from the endosome to the trans‐Golgi network mediated by the retromer is required for fungal development and pathogenicity in Fusarium graminearum[J]. New Phytologist,2016,210(4): 1327-1343. (IF= 7.21)

  4. Jun Wu†, Yanjun Kou†, Jiandong Bao†, Ya Li, Mingzhi Tang, Xiaoli Zhu, Ariane Ponaya, Gui Xiao, Jinbin Li, Chenyun Li,Min-Young Song, Christian Joseph R. Cumagun,Qiyun Deng, Guodong Lu, Jong-Seong Jeon, Naweed Naqvi, Bo Zhou*. Comparative genomics identifies the Magnaporthe oryzae avirulence effector AvrPi9 that triggers Pi9-mediated blast resistance in rice. New Phytologist, 2015, 206(4): 1463-1475. (IF=7.672)

  5. Huawei Zheng†, Wenhui Zheng† , Congxian Wu , Jie Yang, Yang Xi , Qiurong Xie , Xu Zhao, Xiaolong Deng, Guodong Lu, Guangpu Li, Daniel J Ebbole, JieZhou*, Zonghua Wang*.Rab GTPases are essential for membrane trafficking-dependent growth and pathogenicity in Fusarium graminearum[J]. Environ Microbiol. 2015, 17(11), 4580–4599. (IF=6.201)

  6. Xiaohong Liu†, Simiao Chen†, Huimin Gao†, Guoao Ning, Huanbin Shi, Yao Wang, Bo Dong, Yaoyao Qi, Dongmei Zhang, Guodong Lu, Zonghua Wang, Jie Zhou*, Fu-Cheng Lin*.The small GTPase MoYpt7 is required for membrane fusion in autophagy and pathogenicity of Magnaporthe oryzae[J].Environ Microbiol. 2015, doi:10.1111/1462-2920.12903. (IF=6.201)

  7. Qiurong Xie, Ahai Chen, Wenhui Zheng, Huaijian Xu, Wenjie Shang, Huawei Zheng, Dongmei Zhang, Jie Zhou, Guodong Lu, Guangpu Li*,Zonghua Wang*. Endosomal sorting complexes required for transport‐0 is essential for fungal development and pathogenicity in Fusarium graminearum[J]. Environ Microbiol. 2016, 18(11): 3742-3757. (IF= 5.932)

  8. Chuanxin Ma, Hong Liu, Huiyuan Guo, Craig Musante, Sanem Hosbas Coskun, Bryant C Nelson, Jason C. White, Baoshan Xing*, Om Parkash Dhankher*. Defense mechanisms and nutrient displacement in Arabidopsis thaliana upon exposure to CeO2 and In2O3 nanoparticles[J]. Environmental Sciences Nano, 2016,3, 1369-1379.(IF= 5.869)

  9. Hong Liu, Chuanxin Ma, GC Chen, Jason C. White, Zonghua Wang, Om Parkash Dhankher, Baoshan Xing*. Titanium dioxide nanoparticles lower the toxicity of tetracycline to Arabidopsis thaliana[J]. Sustainable Chemistry & Engineering. 2017 (accepted, IF= 5.267)

  10. Ya Li, Jindong Zhu, Jiexiong Hu, Xiuli Meng, Qi Zhang, Kunpeng Zhu, Xiaomin Chen,Xuehang Chen, Guangpu Li, Zonghua Wang, Guodong Lu*. Functional characterization of electron-transferring flavoprotein and its dehydrogenase required for fungal development and plant infection by the rice blast fungus[J]. Scientific reports, 2016, 6. (IF= 5.228)

  11. Zhenhui Zhong, Justice Norvienyeku, Meilian Chen, Jiandong Bao, Lianyu Lin,Liqiong Chen, Yahong Lin, Xiaoxian Wu, Zena Cai, Qi Zhang, Xiaoye Lin,
    Yonghe Hong, Jun Huang, Linghong Xu, Honghong Zhang, Long Chen, Wei Tang,
    Huakun Zheng, Xiaofeng Chen, Yanli Wang, Bi Lian, Liangsheng Zhang, Haibao Tang,Guodong Lu, Daniel J. Ebbole, Baohua Wang*,Zonghua Wang*. Directional Selection from Host Plants Is a Major Force Driving Host Specificity in Magnaporthe Species[J]. Scientific reports, 2016, 6. (IF= 5.228)

  12. Huakun Zheng, Simiao Chen, Xiaofeng Chen, Shuyan Liu, Xie Dang ,Chengdong Yang , Martha C. Giraldo , Ely Oliveira-Garcia , Jie Zhou *,Zonghua Wang *, Barbara Valent*. The Small GTPase MoSec4 Is Involved in Vegetative Development and Pathogenicity by Regulating the Extracellular Protein Secretion in Magnaporthe oryzae[J]. Frontiers in Plant Science, 2016, 7. (IF= 4.495)

  13. Y Zhang , NI Verhoeff, Zaijie Chen, Songbiao Chen, Mei Wang, Zhen Zhu, P B F Ouwerkerk*.Functions of OsDof25 in regulation of OsC4PPDK[J].Plant Mol Biol. 2015, 89:229-242.IF: 4.257

  14. Dagang Tian, Zaijie Chen , Ziqiang Chen , Yuanchang Zhou*, Zonghua Wang , Feng Wang ,Songbiao Chen*. Allele-specific marker-based assessment revealed that the rice blast resistance genes Pi2 and Pi9 have not been widely deployed in Chinese indica rice cultivars[J].Rice,2016,9:19.( IF=3.417)

  15. Gaili Fan , Kai Zhang, Hao Huang, Heng Zhang, Ao Zhao , Libin Chen, Ruiqi Chen, Guangpu Li,Zonghua Wang, Guo dong Lu*. Multiprotein-bridging factor 1 regulates vegetative growth, osmotic stress, and virulence in Magnaporthe oryzae[J]. Current Genetics, 2016: 1-17. (IF= 3.385)

  16. Khalid Abdelkarim Omer Matar, Xiaofeng Chen, Dongjie Chen, Wilfred Mabeche Anjago,  Justice Norvienyeku ,Yahong Lin, Meilian Chen,Zonghua Wang, Daniel J. Ebbole, Guodong Lu*. WD40-repeat protein MoCreC is essential for carbon repression and is involved in conidiation, growth and pathogenicity of Magnaporthe oryzae[J]. Current Genetics, 2016: 1-12. (IF= 3.385)

  17. Hong Liu*, David Weisman , Ling Tang, Long Tan, Wenke Zhang, Zonghua Wang, Yanhe Huang, Wenxiong Lin, Xuanming Liu, Adán Colón-Carmona*. Stress signaling in response to polycyclic aromatic hydrocarbon exposure in Arabidopsis thaliana involves a nucleoside diphosphate kinase, NDPK3[J]. Planta. 2015, 241(1):95-107. (IF= 3.239)

  18. Xu Heng†, Jiandong Bao†, Jisong Dai, Yongqing Li , Ying Zhu*. Genome-Wide Identification of New Reference Genes for qRT-PCR Normalization under High Temperature Stress in Rice Endosperm[J]. PLoS ONE, 2015, 10(11): e0142015. (IF=3.234)


团队构成:

负责人王宗华周洁

成员陈晓婷陈松彪刘泓刘波余文英鲍坚东郑文辉陈晓峰


团队成员简介:

王宗华,博士、研究员、博导,中国植物病理学会副理事长、国际稻瘟病科学委员会委员、福建省植物病理学会理事长和Mol Plant PathologyPLoS OneJ Integrative Agriculture编辑等学术职务,曾在国际水稻研究所担任项目科学家,美国康乃尔大学和密执根州立大学从事博士后研究,系国家有突出贡献中青年专家和国家“百千万人才工程”第一、二层次人选。

研究领域:分子植物病理学、真菌遗传学、植物与微生物相互作用分子生物学

承担课程:现代微生物学,现代生物化学与分子生物学,现代植物病理学进展

获奖情况

  1. 重要作物病原菌的群体遗传结构及其变异机制研究,福建省自然科学奖(2015)

  2. 基于新型基因工程单链抗体的真菌毒素及病原微生物检测,福建自然科学二等奖(2010

  3. 西藏麦类作物条锈病综合防治研究,西藏自治区科技进步一等奖(1991

  4. 西藏农业病虫草害及天敌资源调查研究,国家科学技术进步二等奖(1990

联系方式:wangzh@fafu.edu.cnzonghuaw@163.com

周洁,博士、教授、博士生导师。中国生化学会会员,美国植物病理学会会员。曾于2011年和2014年赴美国德州农工大学(Texas A&M University美国俄克拉荷马大学健康科学中心(Oklahoma University Health Science Center访问研究,先后主持和参加国家自然科学基金重点项目、国家基金面上项目、农业部转基因转项、福建省自然科学基金和省教委重点项目等科研项目。以第一作者和通讯作者(包括共同第一、共同通讯作者)在《New Phytologist》和《PLoS Genetics》《Environmental Microbiology》等国际知名刊物上发表SCI论文10余篇,影响因子超过30

 培养毕业的研究生(硕士生)多名赴国外知名大学攻读博士学位,博硕士研究生多次获得研究生国家奖学金,校“三好生”、“优秀干部”和“优秀毕业生”等荣誉。

研究领域

 植物病原真菌(稻瘟病菌、禾谷镰刀菌)的基因功能

 植物与病原物相互作用的生物化学与分子生物学

承担课程:本科生《生物化学》、硕士生《高级生物化学》等。

获奖情况校优秀教师2004),福建省科技进步奖三等奖(2004第三名)校大学生科技创新行动园丁奖2005),福建省科技进步奖二等奖(2010第五名)

联系方式:yxxc19204@126.com


陈晓婷,女,196812月生,博士,教授、硕士生导师。1990年本科毕业于北京师范大学化学专业,2002年获福建农业大学土壤学专业硕士学位,2008年获福建农林大学农药学专业博士学位。2004.7-2005.1中科院遗传与发育生物学研究所访问学者,2012.7-2013.7美国霍华德大学访问学者。近五年先后主持或参与多项国家和部省级科研课题,在国内外发表学术论文20多篇,先后指导硕士研究生10人。

研究领域:植物逆境生理生化与分子生物学

承担课程《实验化学》、《普通化学》、《有机化学》、《生物有机化学》

科研奖励:水稻广谱防御基因的克隆与功能分析》获福建省2009年度科学技术二等(排名第四)

授权专利:陈晓婷 王桐信,王宗华:一种甲基硫菌灵纳米农药的制备方法(专利号:ZL201310550703.7;授权日:2014.12.31

联系方式:levtring@126.com

陈松彪,博士,研究员,福建省首批引进高层次创业创新“百人计划”人才,福建省农业科学院植物分子免疫科技创新团队首席专家。毕业于中国科学院遗传与发育生物学研究所,获得博士学位;曾在美国俄亥俄州立大学从事博士后、高级研究助理工作。长期从事植物分子生物学、植物分子免疫和功能基因组学研究,近年来致力于以遗传学策略解析植物分子免疫机制的研究。在Plant CellProc Natl Acad Sci USAPlant PhysiologyMolecular Plant-Microbe Interaction等刊物发表研究论文近20篇;先后主持和参加国家自然科学基金项目、福建省自然科学基金杰出青年项目和国家“863”计划、“973”计划、转基因重大专项等科研项目研究领域:植物分子病理学、植物分子遗传、植物功能基因组学

联系方式13338400296sbchen@fajge.org;songbiao_chen@hotmail.com


刘泓,博士,教授, 福建省环境科学学会、土壤肥料学会理事。1990年毕业于贵州农学院土壤与农业化学系,获农学学士学位;1993年毕业于西南农业大学资源环境学院植物营养专业,获农学硕士学位;2007年毕业于福建农林大学生命科学学院生态学专业,获理学博士学位; 1998年至1999年在浙江大学做访问研究;1999年至2000年在加拿大戴尔豪斯大学进修; 2009年至2010年在美国麻省大学波士顿分校从事博士后研究,2013年至2015年在美国麻省大学阿姆赫斯特分校合作研究。 1993年至今在福建农林大学资源与环境学院任教。先后主持了国家自然科学基金、农业部转基因生物新品种培育重大专项、省自然科学基金、省教育厅及项目等多项科研项目,先后在Environmental Science & TechnologySustainable Chemistry & EngineeringEnvironmental Sciences NanoPlataPlant Science、应用生态学报、中国生态农业学报等刊物上发表论文三十余篇,主要参与的两项研究获福建省科学技术三等奖。先后被授予校优秀教师、优秀教学奖。

研究领域:植物环境毒理、污染生态、植物营养

承担课程:土壤有机污染生态学》、《环境质量评价》、《植物营养学》

联系方式:fjauliuhong@163.com

刘波,博士,研究员,福建农林大学研究生导师,福建省农科院院长,兼任中国青年科协委员,中国农学会高新技术农业应用专业委员会理事,福建省科协常委,福建省生物化学及分子生物学学会副理事长,福建省农学会副会长,福建省昆虫学会副理事长,《中国生物防治》和《福建农业学报》编委,中德生防合作研究项目中方首席科学家。

研究经历

     作为中德合作项目、国家863项目、国家基金,国家引智办项目、省农业重大项目主持人,从事环保农业技术和生物农药的研究和应用。主持中德国际合作项目、863项目等科研课题21个,获国专家利8项,农业部丰收一等奖1项,国家科委星火科技三等奖1项,省科技进步二等奖1项、三等奖2项;获中国青年科技奖(1992)、全国优秀留学回国人员奖(1996)、省级优秀专家(1997)、享受国务院政府津贴(1997)、入选国家“百千万”人才第一、二层次管理(1997), 省“五一”劳动奖章(1999)。在国内外学报上发表论文100多篇,出版专著4本,其中在国际专业学报(SCI)上发表论文15篇,在德国出版英文专著2本,7篇论文获全国和省学会优秀论文奖。

个人主页http://www.faas.cn/3/2005-03-07/1491.htm

余文英,博士,副教授。1998年获福建农业大学植物保护专业学士学位,2003年获福建农林大学植物学专业硕士学位,2010年获福建农林大学植物病理学专业博士学位。2013年以访问学者身份赴美国德州农工大学植物病理与微生物系为期一年的研修。目前主持国家自然科学基金青年基金项目1

研究领域:镰刀菌真菌毒素产生机理以及调控因素

承担课程:《微生物》、《微生物生理生化》、《微生物检验检测》

联系方式:wenyingyu2004@126.com

鲍坚东,男,1981年出生,浙江宁海人,博士,福建农林大学生命科学院生物信息系讲师。2005年本科毕业于浙江大学生科院生物技术系,随后留校免试直攻博,先后师从朱军教授和樊龙江教授,2011年获得浙江大学生物信息学博士。毕业后进入浙江省农科院病生所周波课题组从事博士后研究。期间分别于2009年和2012年访问过德国基尔大学植物分子病理研究所和菲律宾国际水稻所。2014年入选金山学者“青年学术新秀”,2015年获得校杰青项目资助。在《New Phytologist》、《Scientific Reports》、《PLoS ONE》、《Molecular Breeding》等学术刊物上发表SCI论文多篇;主持国家自然科学基金青年项目1项,校杰青项目1项,参与国家自然科学基金青年项目1项。博士期间主要研究中国糯玉米起源和糯性突变的分子机制,博士后期间转向研究稻瘟菌无毒基因变异机制并利用比较基因组学方法克隆到了AvrPi9。目前美国范德堡大学流行病学中心做访问学者。

研究方向:利用生物信息学方法研究稻瘟菌和水稻互作过程中的变异机制

承担课程:本科生课程《生物信息学程序设计》、《生物信息综合实验》和《生物信息学》

联系方式:baojd@fafu.edu.cn


 

郑文辉,博士,特聘副教授,中国植物病理学会会员、美国植物病理学会会员。2013-2014先后在美国德克萨斯农工大学和新加坡国立大学淡马锡研究所访学。曾获福建省优秀博士论文,先后主持福建农林大学优博基金、植保学院特别资助基金及青年基金、中国博士后基金、国家自然科学基金青年基金等项目。以第一作者或通讯作者(包括共同第一、共同通讯作者)在 《PLoS Genetics》、《New Phytologist》和《Environmental Microbiology》等国际知名刊物上发表SCI论文8篇,影响因子超过35

    主要研究病原真菌(稻瘟病菌,禾谷镰刀菌)发育和侵染寄主的分子机制及寄主的分子免疫机制;研究囊泡转运和细胞自噬的联系,分析囊泡分拣事件对病原真菌发育及致病的作用。涉及学科:植物病理学、微生物学、分子生物学、分子遗传学、细胞生物学、生物化学等。

联系方式wenhuiz@126.com


陈晓峰博士、博士后。毕业于福建农林大学生命科学学院,获得理学博士学位;曾在美国德克萨斯农工大学从事博士后工作。长期从事病原真菌分子遗传学和功能基因组学研究,目前的主要研究方向是稻瘟病菌小G蛋白和效应因子的功能鉴定及其相关信号传导途径的研究,研究成果发表在Current Opinion in Plant BiologyFungal Genetics and Biology等学术刊物上。主持国家自然科学基金青年科学基金项目1项,先后参与国家自然科学基金重点项目、重要研究计划培育项目项目国家“973”计划等6科研项目。目前研究方向是利用分子遗传学与功能基因组学方法解析稻瘟病菌与水稻互作的分子机制。

联系方式verry@163.com



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